Este é o departamento que presta assistência aos missionários enviados pela Igreja e conscientiza os demais membros quanto à responsabilidade da obra missionária em todo o mundo. A Secretaria de Missões também ajuda na instrução quanto ao recrutamento, seleção, envio, retorno e assistência aos missionários no campo, na orientação de projetos missionários e também o acompanhamento dos mesmos no campo.